Für die Verwaltung bzw. die Kontrolle und Durchführung der Depotbank werden für diese Leistung Kosten fällig, welche direkt aus dem Fondsvermögen an die Depotbank bezahlt werden. Anleger werden also nicht direkt belastet. Die Wertentwicklung des Fonds wird dennoch von den Depotbankgebühren beeinflusst – das kann sich negativ auf die Rentabilität der Anlage auswirken. Depotbankgebühren sind also jene Kosten, welche die Depotbank für die Verwahrung und Verwaltung der Fondsanteile erhebt.